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细菌基因组测序

产品价格: ¥16000.00

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暂无
所在地区:
中国上海
有效期至:
长期有效
最后更新:
2021-05-29 01:30:05
浏览次数:
50

产品详情

品牌名称:
提供商: 上海吐露港生物科技有限公司
服务名称: 细菌基因组测序
规格: 细菌基因组(<5M)

细菌基因组测序

服务简介
随着新一代测序技术的迅猛发展,全基因组测序已经成为细菌基因组研究不可或缺的重要工具。下一代高通量测序技术大大降低了细菌基因组研究的成本,缩短了研究周期,为越来越多的实验室提供了细菌基因组研究的便利。吐露港生物科技采用PacBio平台结合Illumina测序平台,可以提供高效、快速、廉价的细菌基因组完成图。

服务类型
根据不同的研究目的和需求,吐露港提供以下3类服务供选择:
(1)细菌精细图:采用大片段加小片段建库,然后利用Illumina HiSeq2500深度测序和初步的基因组组装策略,性价比高,满足细菌基因组研究基本需求。
(2)细菌完成图:综合利用PacBio RSII(第三代单分子实时荧光测序技术)结合Illumina HiSeq2500深度测序,根据菌株具体情况制定最优策略,最终得到一条完整的基因组序列(补齐所有的gaps)。
(3)细菌重测序:针对已知基因组序列的细菌,采用HiSeq深度测序,后续分析不依赖于组装,关注基因组变异情况(包括SNP和InDel等),是群体研究的首选。

服务流程

收费标准

 

测序项目 费用(RMB) 周期(工作日)
细菌精细图 1.6万(基因组< 5M);2.2万(基因组>5M) 30
细菌完成图 3.0万(基因组< 5M);4.5万(基因组>5M) 50
细菌重测序 0.2万/1M基因组 20
数据分析 费用(RMB) 周期(工作日)
1.  基因预测 150(对于选择测序服务客户,免费) 5
2. 功能注释 150(对于选择测序服务客户,免费) 5
3. COG分类
(默认COG数据)
150(对于选择测序服务客户,免费) 5
4. 代谢通路构建
(默认KEGG数据库)
150(对于选择测序服务客户,免费) 5
5. tRNA、rRNA预测 150(对于选择测序服务客户,免费) 5
6. 基因组岛预测
(只针对完成图)
200 5
7. 蛋白亚细胞定位 200 5
8. 比较基因组学分析
8.1 SNP分析
8.2 Indel分析
8.3 Pan-genome分析
8.4 基因组结构分析
(8.4只针对完成图)
600 5
9. 次生代谢基因簇分析
(只针对完成图)
400 5
10. 基因组圈图绘制
(只针对完成图)
400 5
11. 进化树分析
(客户提供≥2个参考基因组链接)
200 5
注明:

 

对于所有数据分析(单选或全部),均在5个工作日内完成。

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