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芯片类检测:全基因组表达谱芯片技术服务

产品价格: ¥2000.00

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发货时限:
暂无
所在地区:
中国湖南长沙市
有效期至:
长期有效
最后更新:
2021-05-15 01:30:02
浏览次数:
33

产品详情

品牌名称:
提供商: 嘉美实验
服务名称: 芯片类检测:全基因组表达谱芯片技术服务


实验技术简介:全基因组基因表达谱的检测对疾病研究有非常重要的意义。一方面,基因表达谱的检测可以应用于疾病生物标记物的筛选。另一方面,基因表达谱的检测可以为基因功能研究提供线索,有助于揭示疾病发生发展的分子机制。

 

实验操作流程:
1. 样品RNA抽提:
2. RNA质量检测:
    a. 使用Nanodrop测定RNA 在分光光度计260nm、280nm和230nm的吸收值,以计算浓度并评估纯度
    b. 用甲醛电泳试剂进行变性琼脂糖凝胶电泳,检测RNA纯度及完整性
    c. 提供RNA QC报告
    注意:用于芯片检测的RNA样品,必须是高质量的,完整的,没有RNase污染(降解的样品不能用于标记和芯片检测),没有基因组污染。
3. cDNA/aRNA样品合成和标记
4. 标记效率质量检测:
    使用Nanodrop检测荧光标记效率,标记效率合格以保证后续芯片实验结果的可靠性
5. 芯片杂交:
    在标准条件下将标记好的探针和高密度基因组芯片进行杂交
6. 图像采集和数据分析:
    使用GenePix 4000B芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度,并将实验结果转换成数字型数据保存,使用配套软件对原始数据进行分析运算
7.提供实验报告 包括详细的实验方法以及芯片实验数据和图表
   差异基因筛选、聚类分析、GO分析、Pathway分析、趋势分析(STEM-Analysis)、基因间相互作用网络分析、联合分析

 

实验注意事项:
客户提供:

生物样品(组织、细胞或血清、血浆、细胞培养上清、体液、细胞裂解液、组织裂解液);若客户直接提供组织或细胞,我们需要提取总蛋白并定量。

交付标准:
杂交图片、数据结果及相应聚类和差异分析等结果

其他:
新鲜组织样品的保存与运输(每张芯片需50-100mg组织)
1、使用RNAlater试剂:取新鲜组织(注:生物体死亡后尽快在10分钟内取材),组织块以PBS或生理盐水清洗干净,所用组织必须切至厚度在0.5 cm以下(长宽不限),然后放入装有5倍体积RNAlater的离心管(或冻存管)中。
4℃孵育过夜,此时样品管需要横置以便组织块充分接触到RNAlater,然后转入- 20℃中保存。样品在- 20℃不会冻结,但是溶液中可能有一些晶体出现,这并不影响后续的RNA抽提。冻存样品也可以反复冻溶,其RNA含量和完整性不受影响。
2、RNAlater处理的标本可用常规冰袋4℃低温运输(无需使用干冰- 70℃运输)。
3、 B、使用Trizol试剂:Trizol试剂可抑制RNA酶活性,破坏细胞膜结构以裂解细胞释放出RNA。 取新鲜组织(注:生物体死亡后1分钟内取材料并保存好),组织块以PBS或生理盐水清洗干净,每50~100 mg组织加1 ml Trizol溶液匀浆裂解组织样品,操作最好在冰上进行。
4、匀浆的裂解液4℃短期保存(1个月),-20度或- 70℃长期保存。干冰运输,短期(5天以内)冷藏(4℃)运输亦可。
5、冻存组织的保存与运输
生 物体死亡后尽快(最好在10分钟内)切取新鲜组织,以PBS或生理盐水清洗干净切为小块,立刻放入液氮中冷冻2-3小时后可转入-80℃冰箱保存或着一 直保存在液氮中。冻存组织可放入干冰中直接运输,或者以Trizol4℃下匀浆: 冻存的组织块以液氮研磨后加Trizol或直接加Trizol以电动匀浆器匀浆,匀浆的裂解液干冰运输或短期(5天以内)冷藏(4℃)运输。
哺乳动物培养细胞样品采集、保存与运输——使用Trizol试剂(不建议使用RNAlater)
6、悬浮细胞:悬浮细胞培养液倒入离心管中,离心沉淀细胞,弃去上清液。
7、细胞沉淀(1×107个细胞)中加入1 ml的Trizol裂解液。反复吸打几次后,目视可见细胞层溶解完全。- 70℃保存或干冰运输。注:Trizol处理的标本冷藏(4℃)运输,短期(5天以内)亦可。
8、 贴壁细胞:从培养容器中吸出并弃去培养液。培养瓶中直接加入Trizol试剂,Trizol用量与细胞贴壁面积有关,约15 cm2细胞贴壁面积加入1 ml Trizol。反复吸打几次后,目视可见细胞层溶解完全。- 70℃保存或干冰运输。注:Trizol处理的标本冷藏(4℃)运输,短期(5天以内)亦可。


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