点击图片查看原图

真菌基因组测序

产品价格: 面议

最小起订量:暂无 可售数量:暂无

发货时限:
暂无
所在地区:
中国上海
有效期至:
长期有效
最后更新:
1970-01-01 08:00:00
浏览次数:
3796

产品详情

品牌名称:

真菌基因组测序

 

真菌属于较低等的真核生物,种类繁多,在自然界中分布广泛。据估计,全世界约有150万种真菌,其中包含许多具有重要的药用价值和食用价值的有益真菌,同时也存在着大量引发动植物病害的致病菌。因此,合理利用有益真菌,控制和预防有害真菌对人类的生产和生活具有重要的意义。而真菌基因组的阐明,将为真菌特性的分析提供有用的依据。随着第二代高通量测序技术的成熟,基因组测序成本已大大降低,使得快速而经济的进行真菌基因组测序成为可能,目前真菌基因组学研究已进入了一个快速增长时期。

 

迪奥优势

 

拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,可以根据合作伙伴要求灵活安排实验,实验周期短,质量可靠。

 

拥有Roche 454IIIumina Solexa两种高通量测序平台,合作伙伴可根据具体需求进行选择,以获得最佳的实验结果。

 

技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求在第一时间提供实验方案,解决实验问题,分析实验结果。

 

拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。

 

 

 

生物信息分析

 

 

1. De novo真菌基因组测序

 

1) 基因组序列拼接

 

原始数据统计,基因组覆盖度计算,组装结果统计等。

 

2) 基因注释

 

编码基因预测,基因功能注释(NR,Swiss-Prot,interpro等),Non-coding RNA注释,重复序列注释等。

 

3) 基因功能分类

 

GO分类,KEGG通路分析等。

 

4) 比较基因组及进化分析

 

与近源物种的基因组序列对比,进行SNP,SV等变异结构检测,pan-genomecore-genome组成分析,同源基因分析,进化分析等。

 

2. 真菌基因组重测序

 

1) 原始数据统计

 

2) 短序列mapping至参考基因组

 

3) 分析mapping区域reads的覆盖度,重复性,覆盖碱基的质量及reads方向

 

4) SNPs,inDel,CNVs检测

 

5) 结构变异(SVs)和基因组重排事件分析

 

技术指标

 

基因组覆盖度大于95%,基因区覆盖达到98%以上,Scaffold N50大于300KB,单碱基错误率低于十万分之一

 

实验周期

 

1. De novo真菌基因组测序

 

迪奥生物从获得合作伙伴样品到高通量测序,一般控制在40个工作日左右完成。

 

2.真菌基因组重测序

 

迪奥生物从获得合作伙伴样品,高通量测序到数据分析,一般控制在40个工作日左右完成。

 

 

 

送样要求

 

 

1. 请提供浓度≥200ng/ul.OD值介于1.8-2.0之间的DNA,样品浓度越高越好。

 

2. De novo测序获得精细图,若基因组大小介于10-45Mb之间,需提供至少100ugDNA,若基因组大小大于45Mb,则需要200ugDNA.

 

3. 重测序,DNA总量需≥10ug.

 

4. 样品采用冰袋或干冰运输,防止DNA降解。

 

5. 样品能否制备文库,以我们最后的检测结果为准。

 

6. 请填写完整的送样订单,并提供DNA电泳检测照片,用自封袋密封后随同样品一起送样。

免责声明

本网页所展示的有关【真菌基因组测序】的信息/图片/参数等由的会员【上海迪奥生物科技有限公司 】提供,由【生物实验采购网】会员【上海迪奥生物科技有限公司 】自行对信息/图片/参数等的真实性、准确性和合法性负责,本平台(本网站)仅提供展示服务,请谨慎交易,因交易而产生的法 律关系及法律纠纷由您自行协商解决,本平台(本网站)对此不承担任何责任。您在本网页可以浏览【真菌基因组测序】有关的信息/图片/价格等及提供 【真菌基因组测序】的商家公司简介、联系方式等信息。

在您的合法权益受到侵害时,请您致电,我们将竭诚为您服务,感谢您对【生物实验采购网】的关注与支持!

网站首页 | 关于我们 | 联系方式 | 使用协议 | 版权隐私 | 网站地图  |  排名推广  |  广告服务  |  积分换礼  |  网站留言  |  RSS订阅  |  违规举报
 
免责声明:本站有部分内容来自互联网,如无意中侵犯了某个媒体 、公司 、企业或个人等的知识产权,请来电或致函告之,本网站将在规定时间内给予删除等相关处理。