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设计的飞跃使蛋白质纳米机器的创造

设计的飞跃使蛋白质纳米机器的创造

现在,实验室已将蛋白质设计成拉链,其方式与DNA分子拉链形成双螺旋的方式大致相同。该技术的发展由华盛顿大学医学院的科学家领导,可以设计蛋白质纳米机器,可以帮助诊断和治疗疾病,允许更精确的细胞工程和执行各种其他任务。“对于任何机器来说,它的部件必须精确地结合在一起,”该论文的主要作者和生物化学的华盛顿大学研究生Zibo Chen说。“这项技术使您可以设计蛋白质,使它们完全按照您的要求聚集在一起。”研究结果发表于12月19日的“自然&rdq【详细】

2019-04-28 09:07:51 59

发现蛋白质的新相互作用机制

发现蛋白质的新相互作用机制

UZH的研究人员发现了一种以前未知的方式,即蛋白质相互作用,细胞自我组织。这种新机制涉及两种完全非结构化的蛋白质,由于其相反的净电荷,形成超高亲和力的复合物。由于三维结构中的形状完美匹配,蛋白质通常彼此结合。蛋白质是最重要的生物分子之一,是细胞之间和细胞内分子交流的关键介质。对于要结合的两种蛋白质,它们的三维结构的特定区域必须精确地彼此匹配,因为钥匙适合锁定。蛋白质的结构对于它们的功能和触发细胞中所需的反应非常重要。现在,苏黎世大学的研究人员与丹麦和美国的同事一起发现,非结构化蛋白质也【详细】

2019-04-27 15:38:23 66

性别和饮食特异的蛋白质组差异杰出

性别和饮食特异的蛋白质组差异杰出

旧的自然与培育的想法正在获得一个新的维度,礼貌的蛋白质组学,一个致力于蛋白质组的全面表征的科学学科,个体生物或细胞内的蛋白质宇宙。与基因组不同,基因组是遗传信息的静态存储库,蛋白质组是动态的,根据环境或生活方式的影响而波动。由于蛋白质组可能会波动成健康或疾病维持的配置,影响个人蛋白质组的环境或生活方式影响可能会成为或打破新形式的个性化医疗。为了确定遗传和环境对蛋白质组的影响程度,海德堡欧洲分子生物学实验室(EMBL)的科学家分析了11个大型公共数据集,其中包含人类和小鼠中不同蛋白质类型【详细】

2019-04-27 14:27:26 103

研究表明蛋白质功能的进化变化尊重生物物理学原理

研究表明蛋白质功能的进化变化尊重生物物理学原理

研究调节细胞操作的蛋白质的一些分子生物学家,包括马萨诸塞大学阿默斯特分校的Elizabeth Vierling,并不局限于他们的研究,以了解分子的当前作用。他们还深入了解蛋白质的进化过去,探索哪些结构允许具有新功能的蛋白质发展以满足新的需求。作为植物如何应对高温的专家,Vierling多年来的兴趣一直是小型热休克蛋白(HSPs),它在高温下积累在植物中,并且似乎充当“分子伴侣”以保护其他蛋白质免受损害。 对于当前发行的科学报道的工作,Vierling,Indu【详细】

2019-04-26 11:52:08 131

解开构成个体蛋白质组的因素

解开构成个体蛋白质组的因素

根据一项新研究,蛋白质组的构成很大程度上受到动物性别和饮食的影响。有朝一日,对个体蛋白质组中这些和其他潜在因素的理解可为个性化治疗提供基础。该研究由EMBL Heidelberg的科学家完成,并于今天在Nature Communications上发表。分析显示,大约12%的个体的蛋白质变异是由性别和饮食决定的,其中很大一部分比研究人员预期的要高得多。到目前为止,根据动物的遗传性质或其饮食,已知只有少数蛋白质被上调或下调。例如,在性别特异性差异的情况下,大多数通常可追溯到X / Y特异性【详细】

2019-04-26 09:54:59 84

关键极性蛋白质未被发现

关键极性蛋白质未被发现

根据发表在“细胞生物学杂志”上的一项研究,西北医学科学家已经发现了一种名为CLAMP的蛋白质,这种蛋白质组织细胞并允许一些细胞发挥特殊功能。虽然平面细胞极性(PCP)是一种对早期发育至关重要的机制,但它在脊椎动物中仍然相对未被充分研究,根据细胞和分子生物学副教授,该研究的资深作者Brian Mitchell博士的说法。 PCP使用蛋白信号传导途径,以形状的细胞的细胞骨架和对齐的内部结构单元沿轴线。根据米切尔的说法,PCP对于纤毛细胞特别重要:使用小毛发结构来执行【详细】

2019-04-25 10:48:23 161

酿酒师的蛋白质和啤酒故事

酿酒师的蛋白质和啤酒故事

将大麦谷物转化为啤酒是一个古老的故事,通常由水,酵母和啤酒花主演。现在,在“蛋白质组研究杂志”的一篇报道中,科学家们正在强调这个故事中的另一个特征:蛋白质。结果有朝一日可以带来更好,更美味的啤酒。啤酒中的许多蛋白质来自用于制作它的大麦或酵母,这些蛋白质影响啤酒的特性,包括其风味和泡沫。啤酒的蛋白质特征取决于它是如何产生的,这是一个复杂的多步骤过程,具有模糊的生物化学基础。因此,Benjamin L. Schulz,Glen P. Fox,Claudia E. V【详细】

2019-04-25 10:48:17 112

使蛋白质模式健壮

使蛋白质模式健壮

正确的蛋白质定位对许多基本细胞过程至关重要。LMU物理学家现在已经问过如何赋予蛋白质浓度变化对模式形成机制的稳健性。在细胞中观察到的许多基本过程取决于蛋白质的正确定位。例如,发生细胞分裂的分裂平面通过特定蛋白质的正确模式来标记,并且应该对所涉及的蛋白质的相对浓度的改变具有鲁棒性。由Erwin Frey教授领导的Ludwig Maximilian大学物理学家与Petra Schwille教授(慕尼黑马克斯普朗克生物化学研究所)合作,现在探索了如何实现这种稳定性。他们的研究结果发表在PNA【详细】

2019-04-22 10:50:43 127

蛋白质放在适当的位置

将蛋白质放在适当的位置

许多被称为核RNA结合蛋白(RBPs)的特殊分子,当在细胞核外错位时,会形成多种脑部疾病中出现的有害团块,包括额颞叶痴呆(FTD)和肌萎缩侧索硬化症(ALS)。宾夕法尼亚大学佩雷​​尔曼医学院生物化学与生物物理学副教授James Shorter博士说:“由这些疾病蛋白形成的团块由粘性原纤维组成,这些原纤维会破坏神经细胞。”“我们希望逆转这些团块的形成,并将RNA结合蛋白放回核心内的适当位置。”通常,核输入受体(NIR)与RBP上的特定氨基【详细】

2019-04-22 09:45:27 101

部分机械解折叠可调节蛋白质功能

部分机械解折叠可调节蛋白质功能

芬兰坦佩雷大学与伦敦帝国理工学院合作开展的一项研究表明,机械调节蛋白质talin和α-连环蛋白在机械解折叠过程中具有稳定的中间体。稳定的去折叠中间体由三个α-螺旋形成。在这项研究中,使用转向分子动力学模拟,多蛋白工程和单分子原子力显微镜的组合来研究这些蛋白质的去折叠。Talin和α-连环蛋白是α-螺旋蛋白,其在形成大分子复合物中起关键作用,所述大分子复合物使细胞能够与细胞外基质或其他细胞相互作用。 在细胞与其环境之间传递的机械力激活结合并【详细】

2019-04-21 15:09:48 152

用于对抗感染的微珠在烧伤创伤模拟中显示出前景

用于对抗感染的微珠在烧伤创伤模拟中显示出前景

对阻止细菌与宿主细胞结合的微观蛋白质包被珠子的计算机模拟表明,微珠可以帮助减少或消除烧伤中的细菌感染。英国伯明翰大学的Paul Roberts及其同事介绍了由BBSRC资助的PLOS计算生物学的这些新发现。几年前,微珠被开发为抗生素的潜在替代品,抗生素难以快速创新,以跟上对现有药物具有抗性的细菌菌株的迅速出现。微小的塑料球体涂有许多细菌用来结合宿主细胞的相同蛋白质。因此,它们与细菌竞争结合位点,物理地保持它们不附着于宿主细胞。 以前的实验室研究已经证明了微珠治疗大鼠烧伤创面感染的潜力。【详细】

2019-04-21 13:49:23 119

CRISPR引导的邻近标记解剖基因转录的蛋白质组学编排

CRISPR引导的邻近标记解剖基因转录的蛋白质组学编排

比以前的方法更强大,从细胞中标记和收获DNA相关蛋白的新方法可以打开对转录控制的更深入的见解。基因转录需要一个复杂的分子编排技巧,其中许多蛋白质在正确的时间在正确的地方聚集在一起。分离,鉴定和研究这些蛋白质同样复杂,并且现有的这样做的方法虽然强大,但具有限制其效用的限制。例如,广泛使用的染色质免疫沉淀(ChIP)方法依赖于从细胞中捕获蛋白质的抗体。因此,它只能找到一种蛋白质,其中一种蛋白质具有高质量的特异性抗体,并且假定某种蛋白质可能存在于给定基因附近,从而遗漏了人们可能不期望的蛋白质【详细】

2019-04-19 11:17:34 45

确定精子尾部组装中的关键蛋白质

确定精子尾部组装中的关键蛋白质

发表在“细胞生物学杂志”上的一项研究着重于精子尾部的发育,这种结构使精子细胞能够游泳,因此对于男性的生育能力至关重要。由ICREA研究教授Cayetano Gonzalez在生物医学研究所(IRB Barcelona)领导的小组与意大利锡耶纳大学的Giuliano Callaini团队合作,在“细胞生物学杂志”上发表了一项研究,确定了关键作用由一种名为CENTROBIN的蛋白质在精子尾部发育中起作用。 在苍蝇中,如在人类中,精子细胞(精子【详细】

2019-04-19 10:47:25 92

新发现的蛋白质在最早的生物体中运作

新发现的蛋白质在最早的生物体中运作

地球上的生命依赖于光合作用的二氧化碳(CO2)固定形成有机碳。植物吸收大气中的二氧化碳并将其转化为有机分子,如葡萄糖。这个过程在蓝细菌中进化,后来被传递到真核生物,从而在藻类和植物中产生质体。研究人员现在发现了一种参与这一复杂过程的新蛋白质;它调节进入细胞的二氧化碳摄入量。来自微生物学与感染医学研究所(IMIT)的Khaled Selim和Karl Forchhammer教授以及Max-Planck蛋白质进化研究所和罗斯托克大学的同事描述了他们对保守的环AMP受体蛋白SbtB的发现。最【详细】

2019-04-19 09:40:12 72

蛋白质重新充电细胞的运动机械揭示

蛋白质重新充电细胞的运动机械揭示

在赫尔辛基大学进行的研究可能有助于开发能够减缓癌细胞肌动蛋白依赖性运动的特异性抑制剂。线粒体产生的三磷酸腺苷(ATP)是细胞内化学反应的主要能量来源。人通常在一天中产生高达他或她自己的ATP体重。ATP在许多细胞类型中的主要用户是肌动蛋白细胞骨架,其由动态蛋白质细丝组成,其为细胞移动并改变其形状提供力。例如,在神经元和免疫细胞中,估计大约一半的ATP在由肌动蛋白丝的ATP依赖性生长驱动的运动和形态发生过程中消耗。然而,ATP加入肌动蛋白的机制仍然是一个谜。 赫尔辛基大学生物技术研究所的【详细】

2019-04-19 09:40:11 99

疾病的蛋白质组学分析

疾病的蛋白质组学分析

在初诊后5年内,只有四分之一的人被诊断出患有急性髓性白血病(AML)。为了提高存活率,德克萨斯州的研究人员创建了一个在线地图集,用于识别和分类AML诊断中的蛋白质特征。新的蛋白质分类将帮助研究人员和临床医生为患有这种侵袭性癌症的患者推荐更好的治疗和个性化药物。这项突破性研究于本周在Nature Biomedical Engineering上发表。美国德克萨斯大学圣安东尼奥分校的共同资深作者Amina Qutub表示,AML发生在血液和骨髓中,并且“呈现出如此异质的癌症,通常【详细】

2019-04-18 14:52:14 109

深度学习模型从氨基酸序列预测蛋白质结构

深度学习模型从氨基酸序列预测蛋白质结构

哈佛医学院的一位科学家利用深度学习来预测任何基于氨基酸序列的蛋白质的三维结构。在今天发表在Cell Systems上的一篇论文中,系统生物学家Mohammed AlQuraishi详细介绍了一种计算确定蛋白质结构的新方法,他说,实现了与当前最先进方法相当的精确度,但速度提高了一百万倍。“蛋白质折叠一直是生物化学家在过去半个世纪中最重要的问题之一,这种方法代表了应对这一挑战的一种全新方式,”AlQuraishi说。“我们现在有一个全新的远景来探索蛋白质【详细】

2019-04-18 14:52:10 50

两种蛋白质结合在一起保持心脏健康

两种蛋白质结合在一起保持心脏健康

根据美国国立卫生研究院的科学家及其合作者的说法,两种与应激激素结合的蛋白质共同作用,维持小鼠的健康心脏。这些蛋白质,称为糖皮质激素受体(GR)和盐皮质激素受体(MR)的应激激素受体协同作用,有助于支持心脏健康。当两种受体之间的信号传递失去平衡时,小鼠患有心脏病。这项工作(“心肌细胞糖皮质激素和盐皮质激素受体直接拮抗调节小鼠心脏疾病”),发表于科学信号,可能会导致,帮助与心脏发作的风险增加人们治疗化合物的开发,根据研究人员。 “压力越来越多地与心脏功能【详细】

2019-04-18 14:18:16 94

直接可视化蛋白质解聚分子机器的动态结构

直接可视化蛋白质解聚分子机器的动态结构

ClpB是一种以ATP为燃料的蛋白质分子机器,可以解聚并重新激活聚集的蛋白质。通过使用高速原子力显微镜,首次可视化ClpB的构象动力学。ClpB形成开环和闭环,闭环进一步分为三种形式:圆形,螺旋形和扭曲的半螺旋形。这些结构在ATP酶循环期间相互转化以进行蛋白质解聚。该研究将有助于治疗与各种疾病相关并导致工业问题的蛋白质聚集。当蛋白质暴露于热应激之类的应激时,它们会失去其天然结构并形成有毒的不溶性聚集体。细菌分子伴侣ClpB及其酵母同源物Hsp104具有解聚和重新激活聚集蛋白的能力。Cl【详细】

2019-04-17 11:20:10 76

工程蛋白质可以改善药物燃料的生物制造生产

工程蛋白质可以改善药物燃料的生物制造生产

普渡大学的研究人员开发了一系列工程蛋白,可以改善生物制药生产过程,生产生物燃料,药品和商品化学品。在生产过程中积聚有毒物质会损害细胞健康,通常会降低产品的总量。很少有工具可以广泛解决这个问题。普渡大学农业与生物工程系助理教授凯文·所罗门及其团队开发了一系列衍生自弹性蛋白样多肽或氨基酸单链的蛋白质。ELP具有响应于特定环境触发因素(例如温度和pH)的聚集的反相变化特性。研究人员将这些ELP融合到转录因子,与DNA结合的蛋白质,控制基因表达和调节有毒物质的积累。 &ldquo【详细】

2019-04-17 09:47:02 164

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