Snf2染色质重塑DNA转位的机制

2019-03-14来源: 阅读量:176
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染色质remodellers包括具有不同的生物学功能多样的酶,但核小体滑动活性似乎是一个共同的主题1,2。在重塑酶中,Snf2作为研究该蛋白家族作用的原型。Snf2和相关酶共享两个保守的RecA样叶片3,它们本身能够将ATP水解与染色质重塑偶联。由这些酶的夫妇ATP水解易位沿着DNA核小体的机制仍不清楚2,4,5,6,7,8。

Snf2染色质重塑DNA转位的机制

在这里,我们报告酿酒酵母的结构在ADP和ADP-BeF x存在下,Snf2与核小体结合。处于ADP结合状态的Snf2采用类似于apo状态的开放构象,并在超螺旋位置2(SHL2)诱导单碱基对DNA凸起,跟踪链显示出比引导链更大的变形。DNA畸变传播到近端,导致两条链的交错易位。ADP-BeF x的结合触发酶的闭合构象,将核小体重置为松弛状态。Snf2显示在不同核苷酸状态下与DNA的相互作用改变,为DNA易位提供了结构基础。总之,我们的研究结果表明DNA转位的基本机制是染色质重塑的基础。

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