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lnc RNA测序

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暂无
所在地区:
中国上海
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长期有效
最后更新:
2021-05-22 01:30:02
浏览次数:
31
企业信息

产品详情

品牌名称:
提供商: 沃登医学
服务名称: lnc RNA测序
 
lnc RNA测序

一、lnc RNA测序服务介绍
 
长链非编码RNA(long no-coding RNA, lncRNA)是一类长度大于200 nt且不表现出蛋白质编码潜能的RNA,参与了X染色体沉默,基因组印记以及染色质修饰,转录激活,转录干扰,核内运输等多种重要的调控过程,涉及到表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等多个层面。lncRNA测序使用特定方法(如采用Ribo-OffTM系列Kit)降低样本中rRNA的丰度,对富集到的RNA进行文库构建,然后,利用高通量测序产出的数据进行信息分析,能够快速全面、准确地获得与特定生物学过程(例如发育、疾病等)相关lncRNA的信息。
 
本公司拥有一流的 lnc RNA测序技术,我们的测序结果拥有以下优点:1.重复性好:同一样本重复建库相关性pearson值大于0.993;2.序列完整:基于高通量测序技术,能够一次性获得样本中几乎全部的lncRNA信息;3.分析严谨:不局限于对已知lncRNA的研究,还能够进行新lncRNA预测;4.物种多元:能够对包括人类、动植物在内的许多物种的lncRNA进行分析和预测;5.关联全面:能够结合mRNA以及small RNA数据,进行多方位的调控关联分析。

 

二、
lnc RNA测序服务内容
 
1.服务流程:
 
2.标准信息分析:
 
1).测序数据质控;
2).rRNA比对分析;
3).基因组比对分析;
4).样品lncRNA预测;
5).样品转录本覆盖统计分析;
6).表达量分析;
7).差异基因筛选;
8).组间差异基因筛选;
9).表达模式聚类分析; 
10).基于碱基配对的lncRNA-mRNA互作分析; 
11).基因上下游lncRNA的注释; 
12).miRNA前体预测; 
13).lncRNA家族预测。
  
3.个性化信息分析(需要有mRNA以及smallRNA分析结果):

1).mRNA;
2).smallRNA;
3).LncRNA联合分析。
 

 
三、
lnc RNA测序服务说明 

1. 样品类型:去蛋白并进行Dnase处理后的完整无污染总RNA;
 
2. 样品需求量:≥5 μg;
 
3. 样品浓度:≥200 ng/μl;
 
4. 样品纯度:OD260/OD280在1.8-2.2之间,OD260/OD230≥2.0,28S/18S≥1.0, RIN≥7.0, RNA无明显降解;
 
5. 样品保存:请选择乙醇、DEPC水保存样品,并在样品信息单中注明,请勿反复冻融;
 
6.  数据量:6-8G clean data/样本;
 
7. 项目运转周期:标准流程的运转周期为约45个工作日;
 
8.  若另有疑问欢迎向本公司咨询,我们将竭诚为您服务。

 

四、
lnc RNA测序服务质量承诺
 
1.准确可靠的lnc RNA测序结果;
2.专业权威的lnc RNA测序分析报告;
3.真实的原始实验数据;
4.详细的实验步骤。
 

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