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真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定

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1970-01-01 08:00:00
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真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定

 

传统的真菌分类鉴定主要是按照真菌的形态,生长以及生理化等特征对真菌进行分类。然而真菌的种类繁多,个体多态性明显,而且其生长,生理生化特征也会随着环境的变化而不稳定。因此,采用传统的方法对真菌进行正确的分类存在较大的困难。随着分子生物学技术的发展,核酸序列分析已广泛的应用于真菌分类鉴定中,目前常用的技术包括18S rDNA/ITSInternal Transcribed Spacer)及18S rDNA/ITS序列分析技术。

 

18S rDNA是编码真核生物核糖体小亚基Rrna(18S rRNA)DNA序列中既有保守区又有可变区,保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系,而高变序列区域则能体现物种间的差异。由于18S rDNA在进化速率上比较保守,因此在系统发育研究中较适用于种级以上阶元的分类。内转录间隔区ITS位于核糖体rDNA 18S5.8628S之间,由于不需要加入成熟核糖体,因此在进化过程中能够承受更多的变异,其进化速率为18S rDNA10倍,属于中度保守的区域,利用它可研究种及种以下的分类阶元。另外,也可选择引物同时扩增18S rDNAITS,通过分析18S rDNA序列,先在较高级别上确定样品的归属,然后根据ITS序列,将真菌归类到种或亚种水平。

 

 

 

 

 

送样要求

 

 

1. 请提供浓度10ng/ul,总体积≥50ul基因组DNA.

2. 样品定量检测结果将以我们为准。

 

 

 

 

 

实验周期

 

 

实验周期为1-2周,实际完成时间视具体样品而定。

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